科学技术日报,北京,6月10日(记者Zhang Jiaxin)科学家的科学家来自迈阿密大学的Rosenstele海洋,大气和地球科学学院,已经开发了一种创新的生物信息学工具Beren。使用高性能计算机,他们在海洋宏基因组数据集中确定了230个新的兆瓦病毒,并表征了它们的功能。研究结果已发表在最新一期的NPJ病毒杂志上。 MEGAC病毒在单细胞海洋生物的安全性(即质体)的安全中起着重要作用。 Protophytes包括藻类,变形虫和鞭毛,它们构成了海食网的基础。由于这些质体是食物链不可或缺的一部分,因此某些大型DNA病毒通常会引起风险,例如有害藻类开花疫情,影响人类健康。过去,由于生物信息学过程的局限性,巨型病毒已经很长时间没有得到充分测试。目前,团队开发了一个名为B的新工具Eren(用于从环境宏基因组中恢复真核病毒的生物信息工具)可以很好地将大型基因组与以下DNA进行大型公共DNA区分开。他们使用迈阿密大学的超级计算机来处理并积累大量的宏基因组来重建微生物社区数据集。该小组还发现,这些大型病毒基因包含530种新功能蛋白,其中9种与Fotosynsis有关,表明它们可以操纵宿主和感染过程中的Fotosynsiss过程。这项研究建立了一个新的图,用于通过改善现有工具来发现当时的病毒,这将有助于检测未来水道中的污染物和病原体。